GRO-seq、PRO-seq、NET-seq 服务上线
之前我们介绍过EU-Click 捕获新生RNA系列试剂盒,但是这个方法能回答用户的问题吗?
EU-Click 捕获新生RNA系列试剂盒应用场景很广,大多数时候能回答用户的问题。但科学问题的形态千差万别,新生RNA检测从来不是一条路走到底的。GRO-seq、PRO-seq、NET-seq 这些经典的新生RNA研究方法,在各自的问题域里至今无法被替代。
所以在提供高性价比 EU-Click 系列捕获试剂盒的同时,我们把 GRO-seq、PRO-seq、NET-seq、SLAM-seq 技术服务也正式整理上线(货号 YF-007 至 YF-010)。这篇文章说清楚三件事:每个方法适合什么问题、我们的服务凭什么让人放心、以及一份可能超出你预期的物种清单。
一、先分清:四种新生RNA技术,各管一段
| 单碱基分辨率 | ||
总结下来,看响应与增强子,EU-Click 足够;要单碱基级的聚合酶定位和暂停动力学,选 PRO-seq;研究共转录剪接与聚合酶行为,选 NET-seq;需要合成/降解双动力学,看 SLAM-seq。
二、这套服务,我们把功夫下在了你看到数据之前
1. 免费三个维度预实验,先排雷再开跑,降低风险。正式建库前,我们免费做三重验证:RNA 质量、细胞核得率、新生RNA得率。三项全过再进入正式流程,风险前置消化,成功率先立起来。
2. 数据量一步到位。基因组 3G 以内的物种,标准交付 50G 数据。新生RNA 文库的复杂度天然低于稳态转录组,数据量给足,增强子和基因区的信号都能看扎实。
3. 周期透明。预实验 10 天 + 正式实验约 10 周。周期看着不短,但新生RNA 服务的隐性成本恰恰在试错上:预实验免费这一步,跳过的失败轮次远比省下的时间值钱。
4. 个性化分析按文献定制。标准分析之外,可参照目标文献的分析框架定制流程;重新搭建全新分析流程另行评估。
5. PRO-seq 单碱基分辨率,NET-seq 覆盖特殊物种。PRO-seq 精准 run-on 体系可达单碱基分辨率,Pol II 在基因上的精确落点、暂停峰的形态一目了然;NET-seq 依赖特异抗体,针对特殊物种的 NET-seq 可由客户提供抗体,我们负责把流程跑通。
三、已测物种清单(持续更新中……)
新生RNA 服务最难hold的不是流程,而是物种经验。核提取和 run-on 体系对每个物种都是一次重新摸索,而这份清单我们已经替你摸完了:
GRO-seq 已验证物种:
植物:拟南芥、小麦、水稻、烟草、西瓜、芒果、猕猴桃、梨、海带、杨树、油松、百岁兰。
动物:人、大鼠、小鼠、半滑舌鳎、海参、卷叶贝母、鲈鱼、牡蛎、日本鳗鲡、虾。
PRO-seq 已验证物种:
人、大鼠、小鼠、牛、猪、猴子、虾夷扇贝、长江鲟。
NET-seq 已验证物种:
拟南芥、小麦、大豆。
拟南芥和小鼠之外的名单值得细看:海带、百岁兰、牡蛎、虾夷扇贝、长江鲟。做非模式物种转录调控的课题组都懂,能找到一家在这些物种上有实操经验的团队有多难。
but,你的物种不在这份清单里?没关系,带着样本来聊,预实验会给出答案。
四、怎么选,一张表回到起点
把四条技术线放到同一个框架里:
想看刺激后的第一波转录和增强子活性,EU-Click 试剂盒(YF-002)性价比最优;
要画全基因组活跃转录图谱,GRO-seq(YF-007);
要单碱基级 Pol II 动力学,PRO-seq(YF-008);
做共转录剪接与聚合酶足迹,NET-seq(YF-009);
关心 RNA 命运与稳定性,SLAM-seq(YF-010)。
拿不准也没关系,把科学问题发给我们,方案评估不收费。
写在最后
从试剂盒到 GRO/PRO/NET/SLAM 服务,我们希望覆盖新生RNA 研究的每一种方法。模式物种有模式物种的卷法,非模式物种有非模式物种的硬骨头,两条路上都需要一个踩过坑的同伴。
关注“同天生物”公众号,并在后台回复新生RNA,获取技术方案与正式报价,预实验排期先到先得。






